Logo và ý nghĩa

Màu được sử dụng cho Logo là Cyan: màu trung gian giữa màu xanh biển (Blue) và màu xanh lá (Green). Màu Cyan tạo cảm giác êm dịu, thoải mái. 

Trong đó:

• Chữ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH là tên trường; 
• Số 1947 là năm thành lập trường;
• Hai ngôi sao 5 cánh lấy biểu tượng ngôi sao 5 cánh trong quốc kỳ Việt Nam;
• Quyển sách mở là biểu tượng cho công tác giáo dục đào tạo;
• Trang sách bên trái có hình chuỗi ADN biểu tượng cho các môn Khoa học cơ bản trong những năm đầu;
• Trang sách có hình ống nghe biểu tượng cho các môn học về lâm sàng trong những năm sau. Hình ống nghe lấn sang trang sách bên trái thể hiện thời lượng (thời gian) học lâm sàng nhiều hơn;
• Chữ Việt Nam thể hiện tên nước Việt Nam;
• Hình tròn của Logo là hình tượng mặt trời với ý nghĩa rực rỡ, huy hoàng, trường tồn. Hình tròn tạo cảm giác của sự thống nhất, hoàn hảo, trọn vẹn;
• Hình vuông trong hình tròn (quyển sách mở) là hình tượng cho đất với ý nghĩa bền vững, nuôi dưỡng, cân bằng;
• Hình tròn là hình tượng mặt trời, hình vuông là hình tượng của đất, kết hợp với các ngôi sao thể hiện sự hài hòa, khát vọng hướng đến những điều tốt đẹp nhất.
• Logo chính thức sử dụng từ năm 2000.