Phòng Thí nghiệm Y sinh được thành lập năm 1997 với mục tiêu thực hiện các nghiên cứu cũng như các dịch vụ chẩn đoán kỹ thuật cao trong phòng thí nghiệm, có khả năng vận dụng thành thạo các kỹ thuật và phương pháp sinh học phân tử để thực hiện các nghiên cứu y sinh học theo chuẩn mực quốc tế...
Trung tâm Công nghệ thông tin phụ trách về hạ tầng CNTT và ứng dụng vào công tác quản lý, đào tạo và nghiên cứu. Bên cạnh đó, Trung tâm còn thực hiện các dịch vụ xây dựng và phát triển phần mềm, thiết kế website, đào tạo tin học ứng dụng...
Trung tâm đào tạo nguồn nhân lực y tế theo nhu cầu xã hội có chức năng triển khai các hoạt động đào tạo nhân lực y tế ngoài ngân sách; Tổ chức điều phối các hoạt động đào tạo khối dài hạn theo hình thức liên kết hoặc hợp đồng với các cơ sở y tế; Tổ chức đào tạo ngắn hạn...
Giáo dục Y học đóng vai trò quan trọng trong thiết kế chương trình, kế hoạch dạy học, ứng dụng các phương pháp dạy học, ứng dụng các triết lý giáo dục, lượng giá học viên, đánh giá chương trình, đánh giá giáo viên...
Trung tâm Khoa học - Công nghệ Dược được thành lập theo Quyết định của Bộ Y tế số 6815/K2D ngày 20/10/1993; trung tâm có tư cách pháp nhân, có con dấu và tài khoản ngân hàng riêng...
Trung tâm Kiểm chuẩn chất lượng xét nghiệm y học thuộc Đại học Y Dược Thành phố Hồ Chí Minh được thành lập theo Quyết định số 2718/QĐ-BYT ngày 30/7/2010 do Bộ trưởng Bộ Y tế phê duyệt.
Trung tâm khai giảng các khóa đầu tiên là các lớp ngoại tổng quát, chỉnh hình và vi phẫu tạo hình. Hiện tại Trung tâm đã mở thêm các phòng Wetlab cho phẫu thuật mắt, phòng thực hành trên thi thể tươi, là cơ sở giúp trung tâm mở rộng hoạt động giảng dạy của mình...